Il Museo è organizzato attraverso un percorso che permette di rivivere, in ordine cronologico e articolato in cinque padiglioni espositivi per un totale di oltre 16.000 mq, la storia delle Forze Armate in tutte le sue progressive evoluzioni. Un percorso ricco di eventi, fatti, fatti e testimonianze di inestimabile valore che sono eloquente testimonianza dell'audacia e dell'estremo senso del dovere che i nostri avieri si sono tramandati di generazione in generazione, per salvaguardare fedelmente e continuamente il nostro Paese. Sono stati realizzati nuovi spazi, con schermi e aree multimediali, simulatori di volo, una sala cinema, aree relax per i visitatori e suggestivi tunnel di collegamento tra gli hangar a forma originale di carlinga di un aereo. Oltre agli 80 velivoli, sono presenti numerosi cimeli. Tra questi anche il motore funzionante del Flyer, l'aereo utilizzato dai fratelli Wright che volò nel 1909 con il tenente Mario Calderara a Centocelle, e una macchina Enigma esposta in una delle vetrine dell'hangar 'Badoni'